Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DBX1A6NMT0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DBX1A6NMT0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DBX1A6NMT0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DBX1A6NMT0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBX1A6NMT0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DBX1A6NMT0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms