Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP5A6NIR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGAP5A6NIR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP5A6NIR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP5A6NIR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP5A6NIR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP5A6NIR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP5A6NIR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms