Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN8A6NHC0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN8A6NHC0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN8A6NHC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN8A6NHC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN8A6NHC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN8A6NHC0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms