Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WIPF3A6NGB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WIPF3A6NGB9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WIPF3A6NGB9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WIPF3A6NGB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WIPF3A6NGB9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WIPF3A6NGB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms