Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC35F4A4IF30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC35F4A4IF30 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC35F4A4IF30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35F4A4IF30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC35F4A4IF30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC35F4A4IF30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms