Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PS29

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PS29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A1W2PS29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PS29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PS29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A1W2PS29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PS29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PS29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PS29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PS29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PS29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms