Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0U1RQV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RQV1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RQV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A0A0U1RQV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RQV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms