Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0U1RQS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
A0A0U1RQS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0U1RQS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
A0A0U1RQS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms