Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH31

IGHV1-18, Immunoglobulin heavy variable 1-18, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-18A0A0C4DH31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGHV1-18A0A0C4DH31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV1-18A0A0C4DH31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV1-18A0A0C4DH31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV1-18A0A0C4DH31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV1-18A0A0C4DH31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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