Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1Y9

IGHV3-72, Immunoglobulin heavy variable 3-72, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-72A0A0B4J1Y9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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