Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms