Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBV6-7A0A0A0MS04 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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