Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-222ENST00000575009 1146 ntTSL 528.01■■■□□ 2.077e-7■■■■■ 27.2
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-229ENST00000576894 2210 ntTSL 1 (best)22.21■■□□□ 1.157e-7■■■■■ 27.2
UTP3Q9NQZ2 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 312.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 510.05□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 PRC1-217ENST00000560423 755 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-220ENST00000560192 2469 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-205ENST00000472440 430 ntTSL 222.12■■□□□ 1.131e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 ITGA5-207ENST00000551564 354 ntTSL 321.71■■□□□ 1.071e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-208ENST00000486125 936 ntTSL 221.5■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-212ENST00000498631 859 ntTSL 221.5■■□□□ 1.031e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-209ENST00000492715 2612 ntTSL 517.86■□□□□ 0.451e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 WDR13-204ENST00000470124 437 ntTSL 317.12■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 ITGA5-212ENST00000552583 568 ntTSL 215.02■□□□□ -01e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 TCERG1-206ENST00000506524 3787 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 57.28□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.54□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 27.1
UTP3Q9NQZ2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 GET4-204ENST00000426056 502 ntTSL 411.52□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 211.46□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 NSD2-221ENST00000511904 690 ntTSL 58.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 516.98■□□□□ 0.315e-8■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 316.12■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 27
UTP3Q9NQZ2 GLUL-210ENST00000484996 1369 ntTSL 322.55■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 310.62□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LBR-203ENST00000421383 736 ntTSL 326.75■■□□□ 1.875e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 SFSWAP-204ENST00000535399 778 ntTSL 224.31■■□□□ 1.485e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.325e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 322.17■■□□□ 1.147e-8■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 321.98■■□□□ 1.115e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-205ENST00000455158 806 ntTSL 321.86■■□□□ 1.095e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ARHGDIA-214ENST00000583791 351 ntTSL 221.7■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 FUT1-204ENST00000601931 847 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 FUT1-205ENST00000601988 815 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 FUT1-203ENST00000599826 681 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN7-206ENST00000493566 921 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-201ENST00000393633 4792 ntTSL 220.16■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-203ENST00000424611 1956 ntTSL 519.36■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 319.04■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 219.04■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 BTG3-204ENST00000464058 531 ntTSL 218.45■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 318.33■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 517.94■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 26.9
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UTP3Q9NQZ2 BTG3-203ENST00000457956 511 ntTSL 317.06■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-222ENST00000570086 801 ntTSL 316.89■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 216.61■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-211ENST00000493164 807 ntTSL 216.49■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 26.9
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UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-205ENST00000466504 839 ntTSL 315.86■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 215.63■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-212ENST00000527399 1041 ntTSL 515.55■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 26.9
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UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-208ENST00000482288 680 ntTSL 315.47■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-206ENST00000467863 843 ntTSL 515.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-220ENST00000569187 612 ntTSL 215.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 FUT1-202ENST00000597220 649 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-205ENST00000562828 438 ntTSL 215.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-211ENST00000565613 663 ntTSL 515.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -05e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-210ENST00000565514 262 ntTSL 314.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AP1S1-202ENST00000429457 573 ntTSL 514.61□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UNC13D-214ENST00000590856 695 ntTSL 314.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-202ENST00000344591 936 ntTSL 212.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-219ENST00000568228 825 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LDLR-212ENST00000560467 928 ntTSL 312.51□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 MSI2-209ENST00000579483 5141 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01033-201ENST00000504609 735 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 VARS2-210ENST00000490699 719 ntTSL 311.73□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-218ENST00000567593 919 ntTSL 311.61□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-210ENST00000588972 632 ntTSL 511.24□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 26.9
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