Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TIMM9Q9Y5J7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMM9Q9Y5J7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms