Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms