Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX2IPQ9Y2D8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms