Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPT2Q9UMR5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPT2Q9UMR5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms