Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms