Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARFGAP3Q9NP61 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms