Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL4Q9C0H6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms