Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LARP6Q9BRS8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LARP6Q9BRS8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms