Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC34Q96HJ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms