Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP4Q96G21 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP4Q96G21 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP4Q96G21 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP4Q96G21 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP4Q96G21 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP4Q96G21 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMP4Q96G21 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms