Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UPRTQ96BW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPRTQ96BW1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms