Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EXOSC8Q96B26 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms