Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC107Q8WV48 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms