Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC00301Q8NCQ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC00301Q8NCQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms