Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM20Q8N5G0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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