Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms