Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms