Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CARMIL2Q6F5E8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL2Q6F5E8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms