Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms