Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms