Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HS1BP3Q53T59 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms