Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTC4SQ16873 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTC4SQ16873 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms