Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP35Q16560 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP35Q16560 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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