Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KARSQ15046 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KARSQ15046 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KARSQ15046 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KARSQ15046 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms