Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDE6HQ13956 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PDE6HQ13956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6HQ13956 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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