Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL3Q13618 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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