Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PMS2P3Q13401 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms