Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN13Q12923 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN13Q12923 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms