Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DHX9Q08211 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DHX9Q08211 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms