Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHRNEQ04844 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHRNEQ04844 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms