Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNRPEP62304 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPEP62304 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms