Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms