Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTHFRP42898 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTHFRP42898 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTHFRP42898 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms