Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YY1P25490 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YY1P25490 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
YY1P25490 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YY1P25490 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
YY1P25490 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YY1P25490 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YY1P25490 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YY1P25490 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YY1P25490 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YY1P25490 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YY1P25490 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms