Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACO1P21399 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACO1P21399 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACO1P21399 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACO1P21399 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACO1P21399 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACO1P21399 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms