Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GM2AP17900 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GM2AP17900 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GM2AP17900 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GM2AP17900 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GM2AP17900 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GM2AP17900 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GM2AP17900 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GM2AP17900 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GM2AP17900 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GM2AP17900 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GM2AP17900 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms