Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD46P15529 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD46P15529 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD46P15529 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD46P15529 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD46P15529 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD46P15529 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CD46P15529 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD46P15529 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CD46P15529 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD46P15529 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD46P15529 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD46P15529 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD46P15529 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD46P15529 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms